一个全身闪红光的哥斯拉在香港登陆并把港岛和九龙的繁荣商业区破坏後离去及後东京海底队道亦因为隧道机械主轴溶化不停发生事故原来哥斯拉身上的冷却系统已破坏令牠体内核子分裂快速活性化并变成一座懂得步行的核子厂同时东京水族馆发生谜一样的事件—水族馆内的鱼被离奇杀害经研究後发现是一些生活在二亿多年前的地层生物—狄斯亚所造成在临海副都心自卫队派出冷冻战车迎战不明生物—狄斯亚及哥斯拉此时哥斯拉的体温最终到达一千二百度并可能引发全人类灭亡的核爆…